Shinichi Kudo adalah seorang siswa SMA yang mempunyai pengamatan dan kepandaian untuk memecahkan misteri. Suatu ketika dia menyelidiki sesuatu, ia tertangkap oleh penjahat dan dipaksa untuk dicekoki obat-obatan agar mati, penjahat itu kemudian menghilang. Bukannya membunuhnya, namun, obat itu ternyata membuat Shinichi menjadi anak kecil.
Sejauh semua orang yang bersangkutan, Conan hanya anak kecil… bahkan bagi Ran. Ini adalah * sangat * frustasi bagi Conan karena tidak ada yang akan mendengarkan ‘anak kecil. ” Meskipun demikian, Conan memiliki misi … untuk menemukan penjahat yang melakukan ini padanya dan mendapatkan penawar obat.